已知的單基因病致病基因和遺傳方式大部分已明確，不受環(huán)境因素的影響。目前，已知的人類單基因遺傳病已超過10000種，盡管單基因病個體發(fā)病率很低，但人群總發(fā)病率仍較高，約為1/100。大部分單基因病具有致死性、致殘性或致畸性，臨床表現(xiàn)多樣，因此診斷準確率不高。傳統(tǒng)的單基因遺傳病檢測方法主要為Southern印跡法、Sanger測序，以及以PCR技術為基礎的各種檢測手段。

傳統(tǒng)檢測方法的操作步驟復雜、通量低，不易檢測出未知的突變位點和進行全基因組范圍內(nèi)的基因突變分析。通過先進的NGS技術可對上千種由于基因變異（基因突變、平衡異位、微缺失等）導致的遺傳病進行檢測，且可在早期對胎兒的脫落細胞或者絨毛膜進行檢測，在產(chǎn)前就可確認胎兒是否患有遺傳病。目前，NGS技術應用于單基因遺傳病的形式有目標序列捕獲高通量測序技術(Panel)測序、全外顯子組測序、全基因組測序和轉錄組測序等。

Panel測序通過靶向某一已知疾病的全部致病基因，能夠快速高效地分析給定樣本是否患有

該疾病，根據(jù)臨床診斷需要自由設計Panel，靈活方便，但不能有效地預測新的致病基因和對未知疾病的致病基因進行診斷。當Panel測序診斷結果為陰性，或者臨床表型比較復雜時，就需要行全外顯子組測序和全基因組測序，以進行更大范圍的篩查。全外顯子組測序是指對個體外顯子區(qū)進行測序的方法，一般包括22000個左右的編碼基因，能夠更快地確定致病基因及其突變位點，但不能獲得完整的基因組信息，且不適用于非編碼區(qū)突變和DNA結構變異等檢測。

全基因組測序是對某個體基因組的測序，不僅能夠明確患者的基因譜，而且能夠檢測出更多的突變類型，如一些結構變異、拷貝數(shù)變異等；但該方法價格昂貴且數(shù)據(jù)量大，導致數(shù)據(jù)儲存和結果解讀十分困難。全外顯子組測序和全基因組測序應用于潛在遺傳?。ㄉ形创_診）的分子診斷時，診斷準確率為25%～52%。通過TRIO測序（患者及其父母共同進行測序），有助于發(fā)現(xiàn)父母不存在，而孩子新發(fā)生的突變（新發(fā)突變）和潛在的隱性遺傳突變。

轉錄組測序主要是通過對某一物種特定細胞或組織在某個狀態(tài)下的轉錄本和基因序列進行測序，以研究基因的表達情況，從而對非編碼區(qū)功能、結構和新轉錄本的預測等進行研究。